Путешествовал по Мексике вместе с исследователями Мартином де Сессе-и-Лакаста (1751–1808) и Хосе Мариано Мосиньо (1763–1819). Целью экспедиции было исследование и дальнейшее изучение флоры и фауны этой страны. Из-за нестабильной политической обстановки в Новой Испании в ходе Наполеоновских войн эту работу довести до конца не удалось. Несмотря на это сохранилось много работ А. Эчеверрии. В настоящее время они хранятся главным образом в американском институте Ханта, который занимается историей ботаники в Северной Америке. Работы Атанасио Эчеверрии в техническом и художественном плане выгодно отличаются от каких-либо других работ в области ботанической иллюстрации.