Родился в семье Франца Андреаса Маузера, мастера Вюртембергского Королевского оружейного завода в Оберндорф-на-Неккаре. 

В 1867 году братья Маузеры приезжают в известный бельгийский город оружейников Эрсталь под Льежем, и два года разрабатывают винтовочный затвор — усовершенствование затвора ранней французской игольчатой винтовки Шасспо. В 1868 году они совместно с американцем Чарльзом Норрисом запатентовали в США казённозарядную винтовку с новой пластинчатой пружиной на рукоятке затвора.

В 1870 году братья Маузер вернулись в Оберндорф-на-Неккаре. В 1871 году здесь они однозарядную винтовку под патрон 11x60 мм. Винтовка была продемонстрирована в Прусской Королевской стрелковой школе в Шпандау, и была принята на вооружение прусской армии. Был сделан заказ на 100 000 винтовок.

В 1872 году братья Маузер купили у правительства Вюртемберга оружейный завод в Оберндорф-на-Неккаре и создали компанию «Братья Маузер» (Gebrüder Mauser). Вильгельм занимался преимущественно финансовыми и коммерческими вопросами.

Вильгельм Маузер умер в 1882 году, в связи с чем Петер Пауль в 1884 году реорганизовал компанию в акционерное общество Waffenfabrik Mauser AG (акционерное общество «Оружейный завод Маузер» )